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转录组-lncRNA芯片

lncRNA芯片特点

  1. 目前市面上探针密度高的lncRNA芯片产?#20998;?#19968;;
  2. 芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,技术重复性高于99%;
  3.  覆盖主流数据库所有lncRNA,可同时检测lncRNA和mRNA,并挖掘两者之间的关联;
  4.  检出率高?#26680;?#26426;引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRNA,确保更多的lncRNA被检测出来。

 

lncRNA芯片应用

筛选与特定疾病相关的差异表达lncRNA和mRNA,lncRNA的cis/trans靶基因预测及lncRNA功能调控分析。

 

lncRNA芯片技术流程

 

lncRNA芯片分析流程

 

伯豪特色

  1. 成熟的服务平台:稳定而?#20302;?#30340;芯片实验全面解决方案,可为客户提供总RNA抽提、样?#20998;?#26816;、RNA标记、杂交、洗?#36873;?#22270;像扫描、数据分析。
  2. 多样化的服务内容:提供芯片和测序两种高通量检测技术以及低通量检测技术RT-PCR。
  3. 涵盖目前主流lncRNA数据库中的所有lncRNA,提供全面及时更新的lncRNA信息。
  4. 专业的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完?#31579;?#24615;化分析,提供各类高大上的图表。

 

技术参数

 

其它芯片种类

 

案例展示

案例一

上皮细胞到间质细胞的转化(EMT)和肿瘤转移密切相关。近年来的?#33455;?#34920;明lncRNA作为调控因子参与了复杂的生物学过程?#22270;?#30149;的发生发展。来自重庆中医药大学的?#33455;?#20154;员利用lncRNA芯片筛选,?#19994;?#20102;肿瘤细胞迁移相关转录因子Twist诱导的EMT过程相关lncRNA和mRNA。结合GO和pathway分子功能注释,?#33455;?#20154;员建立了Twist诱导EMT相关的下游信号通路。特别是一些参与Twist诱导EMT过程中调控WNT signaling pathway相关的lncRNA的鉴定,为我们更好的理解肿瘤转移过程中Twist通过影响lncRNA而诱导EMT的过程提供了新的见解。本?#33455;縧ncRNA表达谱芯片检测由上海伯豪生物技术有限公司完成。

 

参考文献

[1] LncRNA expression signatures of twist-induced epithelial-to-mesenchymal transition in MCF 10A cells. Cell Signal. 2014 Jan;26(1):83-93. doi: 10.1016/j.cellsig.2013.10.001. Epub 2013 Oct 8.


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