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-Canonical pathways analysis

Demo结果

 

Demo结果解读

从IPA的pathway富集结果中不仅可以看到pathway的富集显著性,并且可以得到pathway的激活抑制的信息。

 

IPA—Canonical pathways analysis介绍

通过IPA的Ingenuity® Knowledge Base数据库,进行Fisher精确检验得到具有显著性意义的pathway。运用客户特定的实验结果来计算每个pathway的z-score值预测pathway激活或者抑制。

 

分析要求

  1. 差异mRNA或者关注的mRNA基因集;
  2. 物种限于人,大鼠,小鼠;
  3. 每个基因有对应的差异倍数。

 

提供结果

  1. 图片格式:pathway柱状图;
  2. 文本格式:pathway的富集结果。

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