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circRNA测序售前常见问题

1.实验最低起始量是多少?
   5ug total RNA

2.普通全转录组测序是否可以测到circRNA?
可以,但找到的circRNA数量要比专门的circRNA建库方法少一个数量级

3.外泌体是否可以做circRNA测序?
可以,最低起始量200ng,不做rRNA去除,但找到的circRNA数目只有几百个。建议1ug以上,可以采取pooling的方式

4.circRNA测序的结果为什么没有circRNA的全长序列?
因为circRNA测序的原理是靠back-splicing位点的reads去识别circRNA,而环上其它位置的序列跟线性RNA是完全一致的,通过二代测序无法区分

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